В конце XV и в начале XVI в., при жизни известного государственного деятеля султана Бабура, Андижан стал столицей Ферганы, главным центром ее торговли и ремесла. В течение своей многовековой истории Андижан служил восточными воротами долины. Через них он осуществлял торговые, экономические и культурные связи со странами Востока. Он славился также производством хлопчатобумажных и шелковых тканей. После присоединения Ферганы к России и строительства железной дороги в Андижане начинает развиваться промышленность.

К 1914 г. в городе насчитывалось 2fi заводов первичной обработки хлопка, но они, как и в других местах долины, были небольшими, с примитивным оборудованием. Все тяжелые работы на них выполнялись вручную. В среднем за сезон каждый из заводов перерабатывал около 4750 т хлопка-сырца, а некоторые всего по 430—450 т. Наряду с фабрично-заводской промышленностью в городе действовало 3500 кустарных заведений, в которых работало более 5 тыс. ремесленников. Андижан был важным перевалочным пунктом России в торговле с Китаем и другими восточными странами.

Через Андижан ежегодно в 1910—1913 гг. проходило 120—140 тыс. пудов различных товаров.