В лесах среди диких плодовых деревьев и кустарников живет кабан, иногда встречается и косуля. В нижней зоне лесов обитает дикобраз, барсук, лесная соня, туркестанская крыса, лесная мышь. Вблизи скал ютится каменная куница, иногда горностай и ласка. Высоко в горах, в скалистых местах, обитает сибирский козел, а по Кугитангтау можно еще встретить редкого теперь винторогого козла.

Встречаются медведь, волк, изредка рысь. Водятся различные мелкие грызуны: полевки, слепушонки и другие. Но особенно много здесь птиц. Лиственные леса изобилуют скворцами, иволгами, дроздами, дятлами, щеглами, соловьями-обитает сова неясыть — истребитель грызунов, сова силюшка, уничтожающая массу насекомых.

В арчевниках живут сорока, арчевый дубонос, вьюрки, горные овсянки, дрозды. На скалах и кручах гнездятся сизые голуби, стрижи и многие хищные птицы: сип, пустельга, гриф, беркут и другие. Выше лесов встречаются участки горных степей. Это заросли типчака — битиге с примесью ковыля-куде и небогатого разнотравья.

Есть здесь и нагорные ксерофиты — астрагал, тау-сагыз. В Узбекистане высокогорий, вообще говоря, очень немного, они располагаются уже за пределами республики.