Особенность институциональной системы Республики Узбекистан это отсутствие Администрации Президента, как важного государственного политического института и независимого центра власти.

Узбекское законодательство утверждает только присутствие Аппарата Президента, его формирует глава государства и он имеет статус органа консультативного (но не органа управляющего государством).

Не имея четкой структуры, Аппарат Президента производит свою деятельность в режиме децентрализованном, однако оказывает самое прямое влияние на внешнюю и внутреннюю политику страны. Секретарь Совета Безопасности и управляющий вопросами Аппарата Президента входят в состав Аппарата Президента.

Общепризнано, что служащие президентского аппарата помимо основной деятельности, представляют собой охранителей созданной президентом политической системы. Эти сотрудники инициируют и наблюдают за судебными процессами против оппонентов политического режима.

Отмечается, что государственная Служба Совета национальной безопасности, а так же Служба государственного советника, и Служба госсоветника по координации функционирования правоохранительных органов, а так же органов безопасности пользуются особенно сильным штатом.

Аппарат президента Узбекистана – сам по себе является негласным скрытым правительством страны. И его закрытая деятельность не имеет отражения в Конституции, или в законах страны, но он имеет огромное влияние. С его помощью президент осуществляет охрану политического спокойствия.

Аппарат подчиняется только Президенту Узбекистана, этот орган следует законам и Конституции Республики Узбекистан, а так же указами, распоряжениями и постановлениями Президента Узбекистана.

Основные задачи этого органа это контроль и проверка исполнения постановлений, распоряжений, и указов Президента Узбекистана; проверка и контроль исполнения его заданий.

Подготовка на основании проведенных проверок материалов для Президента о ходе внедрения рыночных отношений и реформ, совершенствовании деятельности местных и республиканских органов управления, предупреждении злоупотреблений и нарушений, внесение рекомендаций об ответственности за нарушения должностных лиц.